第八十七條 違反本法規定，建設不符合國家產業政策的小型造紙、制革、印染、染料、煉焦、煉硫、煉砷、煉汞、煉油、電鍍、農藥、石棉、水泥、玻璃、鋼鐵、火電以及其他嚴重污染水環境的生產項目的，由所在地的市、縣人民政府責令關閉。
第八十八條 城鎮污水集中處理設施的運營單位或者污泥處理處置單位，處理處置后的污泥不符合國家標準，或者對污泥去向等未進行記錄的，由城鎮排水主管部門責令限期采取治理措施，給予警告；造成嚴重后果的，處十萬元以上二十萬元以下的罰款；逾期不采取治理措施的，城鎮排水主管部門可以指定有治理能力的單位代為治理，所需費用由違法者承擔。
第八十九條 船舶未配置相應的防污染設備和器材，或者未持有合法有效的防止水域環境污染的證書與文書的，由海事管理機構、漁業主管部門按照職責分工責令限期改正，處二千元以上二萬元以下的罰款；逾期不改正的，責令船舶臨時停航。
船舶進行涉及污染物排放的作業，未遵守操作規程或者未在相應的記錄簿上如實記載的，由海事管理機構、漁業主管部門按照職責分工責令改正，處二千元以上二萬元以下的罰款。
第九十條 違反本法規定，有下列行為之一的，由海事管理機構、漁業主管部門按照職責分工責令停止違法行為，處一萬元以上十萬元以下的罰款；造成水污染的,責令限期采取治理措施，消除污染，處二萬元以上二十萬元以下的罰款；逾期不采取治理措施的，海事管理機構、漁業主管部門按照職責分工可以指定有治理能力的單位代為治理，所需費用由船舶承擔：
（一）向水體傾倒船舶垃圾或者排放船舶的殘油、廢油的；
（二）未經作業地海事管理機構批準，船舶進行散裝液體污染危害性貨物的過駁作業的；
（三）船舶及有關作業單位從事有污染風險的作業活動，未按照規定采取污染防治措施的；
（四）以沖灘方式進行船舶拆解的；
（五）進入中華人民共和國內河的國際航線船舶，排放不符合規定的船舶壓載水的。
第九十一條 有下列行為之一的，由縣級以上地方人民政府環境保護主管部門責令停止違法行為，處十萬元以上五十萬元以下的罰款；并報經有批準權的人民政府批準，責令拆除或者關閉：
（一）在飲用水水源一級保護區內新建、改建、擴建與供水設施和保護水源無關的建設項目的；
（二）在飲用水水源二級保護區內新建、改建、擴建排放污染物的建設項目的；
（三）在飲用水水源準保護區內新建、擴建對水體污染嚴重的建設項目，或者改建建設項目增加排污量的。
在飲用水水源一級保護區內從事網箱養殖或者組織進行旅游、垂釣或者其他可能污染飲用水水體的活動的，由縣級以上地方人民政府環境保護主管部門責令停止違法行為，處二萬元以上十萬元以下的罰款。個人在飲用水水源一級保護區內游泳、垂釣或者從事其他可能污染飲用水水體的活動的，由縣級以上地方人民政府環境保護主管部門責令停止違法行為，可以處五百元以下的罰款。
第九十二條 飲用水供水單位供水水質不符合國家規定標準的，由所在地市、縣級人民政府供水主管部門責令改正，處二萬元以上二十萬元以下的罰款；情節嚴重的，報經有批準權的人民政府批準，可以責令停業整頓；對直接負責的主管人員和其他直接責任人員依法給予處分。
第九十三條 企業事業單位有下列行為之一的，由縣級以上人民政府環境保護主管部門責令改正；情節嚴重的，處二萬元以上十萬元以下的罰款：
（一）不按照規定制定水污染事故的應急方案的；
（二）水污染事故發生后，未及時啟動水污染事故的應急方案，采取有關應急措施的。
第九十四條 企業事業單位違反本法規定，造成水污染事故的，除依法承擔賠償責任外，由縣級以上人民政府環境保護主管部門依照本條第二款的規定處以罰款，責令限期采取治理措施，消除污染；未按照要求采取治理措施或者不具備治理能力的，由環境保護主管部門指定有治理能力的單位代為治理，所需費用由違法者承擔；對造成重大或者特大水污染事故的，還可以報經有批準權的人民政府批準，責令關閉；對直接負責的主管人員和其他直接責任人員可以處上一年度從本單位取得的收入百分之五十以下的罰款；有《中華人民共和國環境保護法》第六十三條規定的違法排放水污染物等行為之一，尚不構成犯罪的，由公安機關對直接負責的主管人員和其他直接責任人員處十日以上十五日以下的拘留；情節較輕的，處五日以上十日以下的拘留。
對造成一般或者較大水污染事故的，按照水污染事故造成的直接損失的百分之二十計算罰款；對造成重大或者特大水污染事故的，按照水污染事故造成的直接損失的百分之三十計算罰款。
造成漁業污染事故或者漁業船舶造成水污染事故的，由漁業主管部門進行處罰；其他船舶造成水污染事故的，由海事管理機構進行處罰。
