地方各級人民政府應當統籌規劃建設農村污水、垃圾處理設施，并保障其正常運行。
第五十三條 制定化肥、農藥等產品的質量標準和使用標準，應當適應水環境保護要求。
第五十四條 使用農藥，應當符合國家有關農藥安全使用的規定和標準。
運輸、存貯農藥和處置過期失效農藥，應當加強管理，防止造成水污染。
第五十五條 縣級以上地方人民政府農業主管部門和其他有關部門，應當采取措施，指導農業生產者科學、合理地施用化肥和農藥，推廣測土配方施肥技術和高效低毒低殘留農藥，控制化肥和農藥的過量使用，防止造成水污染。
第五十六條 國家支持畜禽養殖場、養殖小區建設畜禽糞便、廢水的綜合利用或者無害化處理設施。
畜禽養殖場、養殖小區應當保證其畜禽糞便、廢水的綜合利用或者無害化處理設施正常運轉，保證污水達標排放，防止污染水環境。
畜禽散養密集區所在地縣、鄉級人民政府應當組織對畜禽糞便污水進行分戶收集、集中處理利用。
第五十七條 從事水產養殖應當保護水域生態環境，科學確定養殖密度，合理投餌和使用藥物，防止污染水環境。
第五十八條 農田灌溉用水應當符合相應的水質標準，防止污染土壤、地下水和農產品。
禁止向農田灌溉渠道排放工業廢水或者醫療污水。向農田灌溉渠道排放城鎮污水以及未綜合利用的畜禽養殖廢水、農產品加工廢水的，應當保證其下游最近的灌溉取水點的水質符合農田灌溉水質標準。
第五節 船舶水污染防治
第五十九條 船舶排放含油污水、生活污水，應當符合船舶污染物排放標準。從事海洋航運的船舶進入內河和港口的，應當遵守內河的船舶污染物排放標準。
船舶的殘油、廢油應當回收，禁止排入水體。
禁止向水體傾倒船舶垃圾。
船舶裝載運輸油類或者有毒貨物，應當采取防止溢流和滲漏的措施，防止貨物落水造成水污染。
進入中華人民共和國內河的國際航線船舶排放壓載水的，應當采用壓載水處理裝置或者采取其他等效措施，對壓載水進行滅活等處理。禁止排放不符合規定的船舶壓載水。
第六十條 船舶應當按照國家有關規定配置相應的防污設備和器材，并持有合法有效的防止水域環境污染的證書與文書。
船舶進行涉及污染物排放的作業，應當嚴格遵守操作規程，并在相應的記錄簿上如實記載。
第六十一條 港口、碼頭、裝卸站和船舶修造廠所在地市、縣級人民政府應當統籌規劃建設船舶污染物、廢棄物的接收、轉運及處理處置設施。
港口、碼頭、裝卸站和船舶修造廠應當備有足夠的船舶污染物、廢棄物的接收設施。從事船舶污染物、廢棄物接收作業，或者從事裝載油類、污染危害性貨物船艙清洗作業的單位，應當具備與其運營規模相適應的接收處理能力。
第六十二條 船舶及有關作業單位從事有污染風險的作業活動，應當按照有關法律法規和標準，采取有效措施，防止造成水污染。海事管理機構、漁業主管部門應當加強對船舶及有關作業活動的監督管理。
船舶進行散裝液體污染危害性貨物的過駁作業，應當編制作業方案，采取有效的安全和污染防治措施，并報作業地海事管理機構批準。
禁止采取沖灘方式進行船舶拆解作業。
第五章 飲用水水源和其他特殊水體保護
第六十三條 國家建立飲用水水源保護區制度。飲用水水源保護區分為一級保護區和二級保護區；必要時，可以在飲用水水源保護區外圍劃定一定的區域作為準保護區。
飲用水水源保護區的劃定，由有關市、縣人民政府提出劃定方案，報省、自治區、直轄市人民政府批準；跨市、縣飲用水水源保護區的劃定，由有關市、縣人民政府協商提出劃定方案，報省、自治區、直轄市人民政府批準；協商不成的，由省、自治區、直轄市人民政府環境保護主管部門會同同級水行政、國土資源、衛生、建設等部門提出劃定方案，征求同級有關部門的意見后，報省、自治區、直轄市人民政府批準。
跨省、自治區、直轄市的飲用水水源保護區，由有關省、自治區、直轄市人民政府商有關流域管理機構劃定；協商不成的，由國務院環境保護主管部門會同同級水行政、國土資源、衛生、建設等部門提出劃定方案，征求國務院有關部門的意見后，報國務院批準。
國務院和省、自治區、直轄市人民政府可以根據保護飲用水水源的實際需要，調整飲用水水源保護區的范圍，確保飲用水安全。有關地方人民政府應當在飲用水水源保護區的邊界設立明確的地理界標和明顯的警示標志。
第六十四條 在飲用水水源保護區內，禁止設置排污口。
第六十五條 禁止在飲用水水源一級保護區內新建、改建、擴建與供水設施和保護水源無關的建設項目；已建成的與供水設施和保護水源無關的建設項目，由縣級以上人民政府責令拆除或者關閉。
